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分子遗传学
实验室
Molecular Genetics
项目明细
检测项目:

肺癌靶基因cfDNA高深度测序(141基因)

检测方法:

DNA NGS

检测内容:

141个靶基因:①SNV、InDel;②靶基因CNV;③常见融合、MSI和化疗药分析。

临床意义:

◆ 辅助临床诊断:① 肺腺癌的常见改变:EGFR、HER2、KRAS、ALK、MET、RET、ROS1、FGFR1、PIK3CA和BRAF突变或融合;② 肺鳞癌的常见改变:EGFRVIII、PIK3CA、EGFR、DDR2突变和FGFR1的扩增;③ 小细胞肺癌常见改变包括:VEGFR1、2、3和PDGFRB、CDK4/6基因突变及TP53和RB1基因的双等位基因失活; ◆ 指导靶向用药(FDA和或NMPA批准用药):① EGFR突变对其TKI吉非替尼 (Gefitinib)或奥希替尼 (Osimertinib)等敏感;② ALK融合可能对其TKI克唑替尼 (Crizotinib)等敏感;③ ROS1融合对其TKI塞瑞替尼 (Ceritinib)等敏感;④ RET融合对其TKI普拉替尼(Pralsetinib)等敏感;⑤ MET ex14跳跃对其抑制剂卡马替尼(Capmatinib)或赛沃替尼(Savolitinib)等敏感;⑥ BRAF V600E突变可能对达拉非尼(BRAF抑制剂)联合曲美替尼(MEK抑制剂)敏感;⑦ KRAS G12C可能对AMG510敏感;⑧ NTRK融合可能对恩曲替尼(Entrectinib)和拉罗替尼(Larotrectinib)敏感;⑨ Fam-trastuzumab deruxtecan-nxki(Enhertu)在HER2突变的实体瘤中有效,在非小细胞肺癌中获益尤为显著; ◆ 耐药评估:EGFR的耐药,大致分成两类 ① EGFR本身的突变:T790M和C797S突变;② 旁路途径的激活:如MET扩增、HER2扩增等; ◆ 评估免疫治疗:① FDA批准斯鲁利单抗(Serplulimab)用于治疗经过标准治疗失败的、不可切除或转移性高度微卫星不稳定型(Microsatellite Instability-High, MSI-H)实体瘤; ◆ 判定预后分层:① EGFR 20 ins插入突变预后较差;② 在多种恶性肿瘤中,HER2基因突变提示预后不良及生存期短;③ KRAS突变与不良预后有关,对于晚期NSCLC患者,KRAS突变引起的总生存OS较短;④ MET 14外显子跳跃突变患者的预后差;⑤ PI3KCA突变是肺鳞状细胞癌的不良预后因素;⑥ RET融合NSCLC患者的预后较差; ◆ 指导化疗用药:① 基于PharmGKB数据库,检测了2级及以上等级证据支持的化疗有关基因的SNP位点,预测化疗药物的毒性与有效性;② 在精准化疗之前,可进行化疗药物相关基因检测,从而制定个体化的化疗方案,以达到最大的化疗效果和最小的药物不良反应。

报告时间:

10个工作日

样本类型:

外周血/胸腹水/脑脊液

采集要求:

◆ 外周血(cfDNA):游离DNA保存管,≥20ml;或 ◆ 胸腹水(cfDNA):无菌离心管,≥50ml;或 ◆ 脑脊液(cfDNA):游离DNA保存管,≥10ml

保存和运输:

◆ 外周血:室温(15-25℃)保存,48小时内送检 ◆ 脑脊液、胸腹水:2-8℃保存,当天送达