甲状腺癌靶基因测序(66基因)
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检测项目:
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检测方法:
DNA NGS
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检测内容:
66个靶基因:①SNV、InDel;②靶基因CNV;③常见融合、MSI和化疗药分析。
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临床意义:
◆ 辅助良恶性判断:对于细针穿刺(FNA)无法确定良恶性的甲状腺结节(约20%),建议对穿刺标本进行特定甲状腺癌的分子标记物检测,如BRAF突变、RAS突变、RET/PTC重排等,以提高确诊率; ◆ 指导治疗方式:① 有研究显示,如果术前检测BRAF显示阳性,推荐甲状腺全切才安全;② RAS突变的频率不一样,手术切除范围也会不一样;③ NCCN指南:髓样癌中不同的RET突变位点对应不同的治疗方式; ◆ 辅助临床诊断:① 乳头状癌:BRAF、PIK3CA、TP53、RAS和TERTp突变,RET重排,ALK::NTRK;② 滤泡状癌:RAS,EIF1AX,TP53,PTEN突变,PAX8::PPARG;③髓样癌:RET和RAS突变;④ 低分化癌:RAS,TP53,TERTp,BRAF突变;⑤ 未分化癌:TP53,BRAF,RAS,PIK3CA,PTEN和CTNNB1突变; ◆ 指导靶向用药:① BRAF:携带BRAF V600E突变的未分化甲状腺癌患者选用BRAF抑制剂(如:达拉非尼Dabrafenib)联合MEK抑制剂(如:曲美替尼)治疗;② NTRK:对于NTRK融合阳性的晚期实体瘤患者,可选用NTRK抑制剂(如:拉罗替尼Larotrectinib、恩曲替尼Entrectinib);③ RET:携带RET融合的碘难治性甲状腺癌患者可从RET抑制剂(如:塞尔帕替尼Selpercatinib、普拉替尼Pralsetinib)中获益;④ ALK:携带ALK融合的甲状腺癌患者可选择ALK抑制剂(如:克唑替尼Crizotinib等); ◆ 判定预后分层:① BRAF/RAS和TERT启动子双突变具有协同效应,较单基因BRAF或RAS或TERT突变的甲状腺癌更具侵袭性;② RET::PTC1是甲癌中比较常见的突变,在约15%的甲状腺癌患者中存在,通常预后较好,多为经典型甲状腺癌,且具有良好的碘摄取能力;③ RET突变609/611/618/620/630/634,高风险,建议进行预防性全甲状腺切除术;883/918/V804M+E805K/V804M+Y806C/V804M+S904C,高风险,建议诊断的第一年内做甲状腺全切术;768/790/791/804/891,相对其他位点突变风险较小; ◆ 遗传风险评估:① 帮助有肿瘤家族史的高危人群提早进行肿瘤发生风险的评估,提供早期的预防干预方案,降低患病风险;② 对有家族遗传史或生育过患儿的夫妇进行生育指导,有助于避免严重遗传病患儿的出生;③ 为临床实现精准的肿瘤个性化诊断及遗传咨询提供依据;④ 甲状腺髓样癌:约25%的髓样癌可遗传,由胚系RET基因突变所致; ◆ 指导化疗用药:① 基于PharmGKB数据库,检测了2级及以上等级证据支持的化疗有关基因的SNP位点,预测化疗药物的毒性与有效性;② 在精准化疗之前,可进行化疗药物相关基因检测,从而制定个体化的化疗方案,以达到最大的化疗效果和最小的药物不良反应。
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报告时间:
10个工作日
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样本类型:
石蜡切片/固定组织/外周血/口腔拭子
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采集要求:
◆ 石蜡切片:10-15张,4-5μm厚,非粘附载玻片;或 ◆ 固定组织:穿刺组织不少于2条(长度≥5mm),或 手术组织 0.5×0.5×0.5~1cm(黄豆大小),10%中性福尔马林固定;和 ◆ 胚系对照:外周血,EDTA抗凝,≥2ml;或 口腔拭子 ≥2根
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保存和运输:
室温(15-25℃)保存,48小时内送检