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分子遗传学
实验室
Molecular Genetics
项目明细
检测项目:

肝/胆管癌靶基因cfDNA高深度测序(142基因)

检测方法:

DNA NGS

检测内容:

142个靶基因:①SNV、InDel;②靶基因CNV;③MSI、常见融合和化疗药分析。

临床意义:

◆ 辅助临床诊断:① TERT启动子区变异在低级别和高级别肝脏增生性结节中经常出现,被认为是肝细胞癌(HCC)发生的早期分子事件,可作为潜在的辅助临床诊断标志物;② 晚期HCC患者肿瘤组织中可检测到TP53(35%)和WNT/β-catenin信号通路突变(45%),并且表现为相互独立的分子亚型;③ HCC患者中VEGFA扩增率为7%-11%; ◆ 指导靶向用药:① 一项回顾性临床研究提示,携带VEGFA基因扩增的晚期HCC患者,对索拉非尼治疗有较好的反应性;② 携带RAS突变的HCC患者与RAS野生型患者相比,对索拉非尼与瑞美替尼联合治疗有更好的临床反应性;③ 高表达c-MET的HCC细胞中,卡博替尼能够高效抑制MET活性,抑制血管生成、细胞增殖、细胞迁移和侵袭,促进细胞凋亡;④ 美国临床肿瘤学会会议报道,高选择性的共价FGFR4抑制剂(H3B-6527)对于HCC治疗耐受性良好,可使 FGF19 信号传导发生变异的 HCC-CCA 患者获益(NCT02834780);⑤ 美国FDA已批准如厄达替尼、仑伐替尼、瑞戈非尼、普纳替尼、培唑帕尼等多种FGFR的激酶抑制剂用于肿瘤的临床治疗;⑥ 美国FDA批准达拉非尼、维莫非尼和恩考芬尼,以及MEK抑制剂曲美替尼、卡博替尼和比美替尼等BRAF抑制剂单药或联合治疗多种携带BRAF V600位点突变的肿瘤;⑦ 一项晚期 HCC 基因组测序研究报道,仅发现 0.2% 的患者 MSI-H; ◆ 指导化疗用药:① 基于PharmGKB数据库,检测了2级及以上等级证据支持的化疗有关基因的SNP位点,预测化疗药物的毒性与有效性;② 在精准化疗之前,可进行化疗药物相关基因检测,从而制定个体化的化疗方案,以达到最大的化疗效果和最小的药物不良反应。

报告时间:

10个工作日

样本类型:

外周血/胸腹水/脑脊液

采集要求:

◆ 外周血(cfDNA):游离DNA保存管,≥20ml;或 ◆ 胸腹水(cfDNA):无菌离心管,≥50ml;或 ◆ 脑脊液(cfDNA):游离DNA保存管,≥10ml

保存和运输:

◆ 外周血:室温(15-25℃)保存,48小时内送检 ◆ 脑脊液、胸腹水:2-8℃保存,当天送达