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分子遗传学
实验室
Molecular Genetics
项目明细
检测项目:

前列腺癌靶基因cfDNA高深度测序(165基因)

检测方法:

DNA NGS

检测内容:

165个靶基因:①SNV、InDel;②靶基因CNV;③常见融合、MSI和化疗药分析。

临床意义:

◆ 辅助临床诊断:① AR基因扩增、突变或重排和/或AR剪接变体的激活与去势抵抗性前列腺癌(CRPC)相关;② GSTP1基因突变与TMPRSS2::ERG融合是前列腺癌的发生最常见的改变;③ FLI1、SPOP、FOXA1或IDH1基因突变可见于前列腺癌;④ 同源重组修复 (HRR)、错配修复(包括BRCA1、BRCA2、ATM、CHEK2、FANCI、PALB2、MSH2)与转移性前列腺癌相关;⑤ MYC过表达、PTEN的丢失和TP53的失活与前列腺癌疾病进展有关; ◆ 指导靶向用药:① AR基因改变对AR拮抗剂(如:恩杂鲁胺Enzalutamide、阿帕他胺Apalutamide、达罗他胺Darolutamide)敏感;② CYP17基因改变对CYP17抑制剂(如:阿比特龙Abiraterone)敏感;③ NTRK1/2/3融合的前列腺癌患者对NTRK抑制剂(如:拉罗替尼Larotrectinib)敏感; ◆ 遗传风险评估:DNA损伤修复相关(特别是 BRCA2、BRCA1、ATM、PALB2、CHEK2、MLH1、MSH2、MSH6、PMS2)基因的胚系致病变异,提示家族遗传风险; ◆ 指导化疗用药:① 基于PharmGKB数据库,检测了2级及以上等级证据支持的化疗有关基因的SNP位点,预测化疗药物的毒性与有效性;② 在精准化疗之前,可进行化疗药物相关基因检测,从而制定个体化的化疗方案,以达到最大的化疗效果和最小的药物不良反应。

报告时间:

10个工作日

样本类型:

外周血/胸腹水/脑脊液

采集要求:

◆ 外周血(cfDNA):游离DNA保存管,≥20ml;或 ◆ 胸腹水(cfDNA):无菌离心管,≥50ml;或 ◆ 脑脊液(cfDNA):游离DNA保存管,≥10ml

保存和运输:

◆ 外周血:室温(15-25℃)保存,48小时内送检 ◆ 脑脊液、胸腹水:2-8℃保存,当天送达