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分子遗传学
实验室
Molecular Genetics
项目明细
检测项目:

血液系统肿瘤全景DNAseq PLUS(206基因)

检测方法:

DNA NGS

检测内容:

①206基因(含诊断分型、预后、靶药和遗传)突变分析;②全基因组CNV&LOH;③IG/TCR融合;④IG/TCR克隆性分析和IGHV区超突变;⑤多个CAR-T靶点蛋白突变分析。

临床意义:

◆ 辅助诊断和鉴别诊断:有助于分辨髓系和淋系肿瘤,髓系肿瘤常见的突变:FLT3、DNMT3A、NPM1、RUNX1、U2AF1等;淋系肿瘤常见的改变:CDKN2A、KRAS、MYD88、CD79B、IG/TCR相关重排以及IG/TCR单克隆等; ◆ 评估预后:例如在髓系肿瘤AML中,CEBPA bZIP区框内突变提示预后较好;同时发生NPM1和FLT3-ITD突变时,属于中危组。在淋系肿瘤CLL中,del(17p)/TP53突变/del(11q)/BIRC3突变与预后较差有关;12号染色体三体预后中等;单独del(13q)预后良好。在MM中,IGH::CCND1提示预后较好。在DLBCL中,IGH::MYC提示预后较差; ◆ 指导治疗:例如在髓系肿瘤AML中,FLT3、IDH1、IDH2和KIT突变病人可能对相应的抑制剂敏感。淋系肿瘤,在LPL(WM)中,MYD88突变病人可能对依鲁替尼(Ibrutinib)敏感,如果既有MYD88也有CXCR4突变,病人可能对依鲁替尼(Ibrutinib)耐药; ◆ MRD监测:检测确立IG/TCR单克隆序列,有助于后续MRD追踪,评估治疗效果和监测疾病状态; ◆ CNV检测验证补充核型和FISH检测:CNV可以弥补核型分辨率低的劣势,发现关键抑癌基因的缺失,例如在儿童B-ALL中,IKZF1缺失同时伴随CDKN2A、CDKN2B、PAX5或PAR1缺失,预后较差; ◆ 淋巴瘤一般需采用石蜡标本进行基因检测,CNV分析对于辅助区分肿瘤的良恶性不可或缺,DNAseq PLUS包含的CNV分析应用自主开发的AI降噪算法处理,准确性更高; ◆ 全基因组CNV和LOH分析有助于辨别隐匿性亚二倍体以及基因微小缺失等。此外常规的MICM分型检测后,如果还未能找到遗传学异常,需排除LOH或者单亲二体(UPD)改变。

报告时间:

10个工作日

样本类型:

骨髓/外周血/固定组织/石蜡切片

采集要求:

◆ 骨髓:EDTA抗凝,2-4ml;或 ◆ 外周血(肿瘤细胞>20%):EDTA抗凝,3-5ml;或 ◆ 固定组织:穿刺组织不少于2针(长度≥1cm),或手术组织0.5×0.5x0.5~1cm,10%中性福尔马林固定;或 ◆ 石蜡切片:10-15张,4-5μm厚,非粘附载玻片

保存和运输:

室温(15-25℃)保存,48小时内送检