实体肿瘤全景DNAseq PLUS（638基因）

DNA NGS

638个靶基因：①SNV、InDel、常见融合和CNV；②全基因组CNV&LOH；③MSI、TMB、HLA分型、HRD和化疗药；④AI肿瘤原发灶预测。

◆ 辅助临床诊断：① 中央型非典型软骨性肿瘤/软骨肉瘤（ACT/CS1）,1级：IDH1/2突变，热点突变为IDH1 p.Arg132 和IDH2 p.Arg172 位点；IDH1 p.Arg132Cys 突变是最常见的突变;② 中央型软骨肉瘤, 2和3级：大约一半的肿瘤携带IDH1或IDH2突变，这表明它们是从内生软骨瘤和ACT/CS1发展而来的。且在此基础上表现为复杂的染色体拷贝数改变，最初的超单倍体/亚二倍体细胞群的多倍体化是亚群进展的常见机制。86%的高级别软骨肉瘤影响RB1通路，包括CDKN2A的缺失和CDK4的过表达和/或扩增。TP53在20–49％ 的病例中发生突变。约 45% 的中央型软骨肉瘤存在COL2A1基因突变。其他复发性突变涉及YEATS2（12.3%）、EGFR（19%）、NRAS（p.Gln61Lys 和 p.Gln61His；高达12%）。③ 透明细胞软骨肉瘤：无IDH1/2突变，染色体结构以二倍体或近二倍体为主，复发性改变包括9号染色体的丢失和20号染色体的增加。有病例报道可出现H3F3B的突变。④ 间叶性软骨肉瘤:复发性HEY1::NCOA2重排是间叶性软骨肉瘤的特征性改变； ◆ 指导靶向用药：① CDKN2A的缺失或CDK4的过表达和/或扩增的患者可能对CDK4/6抑制剂治疗敏感，IDH突变的患者可能对IDH抑制剂（如：艾伏尼布Ivosidenib）治疗敏感； ◆ 评估免疫治疗：① 一般认为TMB高的肿瘤可能产生更多的肿瘤新生抗原（Neoantigens）。TMB高的患者（TMB≥10muts/Mb）比TMB低的患者对PD-1/PD-L1免疫抑制治疗更加敏感；② MSI-H表型的晚期实体肿瘤倾向于从免疫检查点抑制剂疗法（PD-1/PD-L1抑制剂）中获益；③ HLA-I（HLA-A、HLA-B、HLA-C）杂合性与免疫治疗后生存期的增加相关，三个基因全部杂合的位点对免疫治疗更敏感。HLA-I杂合与TMB高的患者比单独TMB高的患者也具有更高的生存率； ◆ 遗传风险评估：遗传风险评估：① 帮助有肿瘤家族史的高危人群提早进行肿瘤发生风险的评估，提供早期的预防干预方案，降低患病风险；② 对有家族遗传史或生育过患儿的并夫妇进行生育指导，有助于避免严重遗传病患儿的出生；③ 为临床实现精准的肿瘤个性化诊断及遗传咨询提供依据。如：Li-Fraumeni综合征（胚系TP53致病突变所致）表现为明显的家族聚集性、肿瘤早发性以及肿瘤类型多样性（如软组织肉瘤、骨肉瘤、乳腺癌、白血病、脑瘤和肾上腺皮质肿瘤）。TP53突变的个体中，软组织肉瘤的发病率为12%-21%。携带胚系TP53致病突变的患者，应尽量避免使用放疗或具有基因毒性的化疗药物，以防促进新的原发肿瘤出现，并建议每年进行全身MRI监测； ◆ 指导化疗用药：① 基于PharmGKB数据库，检测了2级及以上等级证据支持的化疗有关基因的SNP位点，预测化疗药物的毒性与有效性；② 在精准化疗之前，可进行化疗药物相关基因检测，从而制定个体化的化疗方案，以做到最大的化疗效果和最小的药物不良反应；③ UMPS、DPYD、ERCC1、MTHFR等基因可评估化疗药物的敏感性和毒性。

初诊、转移或复发肿瘤患者。

10个工作日

石蜡切片/固定组织/外周血/口腔拭子

◆ 石蜡切片：10-15张，4-5μm厚，非粘附载玻片；或 ◆ 固定组织：穿刺组织不少于2条（长度≥5mm），或 手术组织 0.5×0.5×0.5~1cm（黄豆大小），10%中性福尔马林固定；和 ◆ 胚系对照：外周血，EDTA抗凝，≥2ml；或 口腔拭子 ≥2根

室温（15-25℃）保存，48小时内送检