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疑难罕见肿瘤

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疑难罕见肿瘤 Rare Tumors
项目明细
检测项目:

实体肿瘤全景DNAseq PLUS(638基因)

检测方法:

DNA NGS

检测内容:

638个靶基因:①SNV、InDel、常见融合和CNV;②全基因组CNV&LOH;③MSI、TMB、HLA分型、HRD和化疗药;④AI肿瘤原发灶预测。

临床意义:

◆ 辅助临床鉴别诊断:① 尤文肉瘤都伴有FET家族与ETS家族成员基因的融合,是其特征性改变,最常见的融合为EWSR1::FLI(约85%),其次为EWSR1::ERG(约10%),可辅助与其他类型的未分化小圆细胞肉瘤(EWSR1–非ETS融合圆细胞肉瘤、CIC重排肉瘤和具有BCOR基因改变的肉瘤)进行区分;② 除了融合基因,尤文肉瘤可能有额外的突变,包括:STAG2(15-22%),CDKN2A(12%),和TP53(7%); ◆ 指导靶向用药:① NTRK融合患者可能对其抑制剂敏感(如:拉罗替尼Larotrectinib)。NTRK融合在成人肿瘤中常见于非小细胞肺癌(0.2%),乳腺癌(0.231%),软组织肉瘤(1.057%)和结直肠癌(0.35%);在儿科肿瘤中常见于软组织肉瘤(1.5%),神经胶质瘤(1.125%)和甲状腺肿瘤(15.3%);② 有病例报道伴PTEN缺失的尤文肉瘤患者,对可泮利塞(Copanlisib)治疗敏感; ◆ 评估免疫治疗:① 一般认为TMB高的肿瘤可能产生更多的肿瘤新生抗原(Neoantigens)。TMB高的患者(TMB≥10muts/Mb)比TMB低的患者对PD-1/PD-L1免疫抑制治疗更加敏感;② MSI-H表型的晚期实体肿瘤倾向于从免疫检查点抑制剂疗法(PD-1/PD-L1抑制剂)中获益;③ HRD阳性患者可能对PARP抑制剂敏感;④ HLA-I(HLA-A、HLA-B、HLA-C)杂合性与免疫治疗后生存期的增加相关,三个基因全部杂合的位点对免疫治疗更敏感。HLA-I杂合与TMB高的患者比单独TMB高的患者也具有更高的生存率; ◆ 遗传风险评估:① 帮助有肿瘤家族史的高危人群提早进行肿瘤发生风险的评估,提供早期的预防干预方案,降低患病风险;② 对有家族遗传史或生育过患儿的并夫妇进行生育指导,有助于避免严重遗传病患儿的出生;③ 为临床实现精准的肿瘤个性化诊断及遗传咨询提供依据; 如:Li-Fraumeni综合征(胚系TP53致病突变所致)表现为明显的家族聚集性、肿瘤早发性以及肿瘤类型多样性(如软组织肉瘤、骨肉瘤、乳腺癌、白血病、脑瘤和肾上腺皮质肿瘤)。TP53突变的个体中,软组织肉瘤的发病率为12%-21%。携带胚系TP53致病突变的患者,应尽量避免使用放疗或具有基因毒性的化疗药物,以防促进新的原发肿瘤出现,并建议每年进行全身MRI监测; ◆ 指导化疗用药:① 基于PharmGKB数据库,检测了2级及以上等级证据支持的化疗有关基因的SNP位点,预测化疗药物的毒性与有效性;② 在精准化疗之前,可进行化疗药物相关基因检测,从而制定个体化的化疗方案,以达到最大的化疗效果和最小的药物不良反应。

适用人群:

初诊、转移或复发肿瘤患者。

报告时间:

10个工作日

样本类型:

石蜡切片/固定组织/外周血/口腔拭子

采集要求:

◆ 石蜡切片:10-15张,4-5μm厚,非粘附载玻片;或 ◆ 固定组织:穿刺组织不少于2条(长度≥5mm),或 手术组织 0.5×0.5×0.5~1cm(黄豆大小),10%中性福尔马林固定;和 ◆ 胚系对照:外周血,EDTA抗凝,≥2ml;或 口腔拭子 ≥2根

保存和运输:

室温(15-25℃)保存,48小时内送检