实体肿瘤全景DNAseq（638基因）

DNA NGS

638个靶基因：①SNV、InDel、常见融合；②靶基因CNV；③MSI、TMB、HLA分型、HRD和化疗药。

◆ 辅助临床诊断：① EGFR、HER2、KRAS、ALK、MET、RET、ROS1、FGFR1、PIK3CA和BRAF等基因是NSCLC腺癌的常见改变；② 肺鳞癌基因组改变复杂，基因突变主要是EGFRVIII、PIK3CA、EGFR、DDR2和FGFR1的扩增；③ SCLC常见改变包括：VEGFR1、2、3和PDGFRB、CDK4/6基因突变及TP53和RB1基因的双等位基因失活。④ EGFR 20 ins插入突变预后较差；⑤ 在多种恶性肿瘤中，HER2基因突变提示预后不良及生存期短；⑥ KRAS突变与不良预后有关，对于晚期NSCLC患者，KRAS突变引起的总生存OS较短；⑦ MET 14外显子跳跃突变患者的预后差；⑧ PI3KCA突变是肺鳞状细胞癌的不良预后因素；⑥ RET融合NSCLC患者的预后较差； ◆ 指导靶向用药：① EGFR突变对其TKI（如：吉非替尼Gefitinib、奥希替尼 Osimertinib）等敏感；② ALK融合可能对其TKI（如：克唑替尼Crizotinib等）敏感；③ ROS1融合对其TKI（如：塞瑞替尼Ceritinib等）敏感；④ RET融合对其TKI（如：普拉替尼Pralsetinib等）敏感；⑤ MET ex14跳跃对其抑制剂（如：卡马替尼Capmatinib、赛沃替尼Savolitinib等）敏感；⑥ BRAF V600E阳性提示可能有BRAF V600E相关分子改变可能对BRAF抑制剂（如：达拉非尼Dabrafenib）联合MEK抑制剂（如：曲美替尼Trametinib）敏感；⑦ KRAS G12C对KRAS G12C抑制剂（如：索托拉西布Sotorasib）敏感；⑧ NTRK融合可能对NTRK抑制剂（如：恩曲替尼Entrectinib、拉罗替尼Larotrectinib）敏感；⑨ 德曲妥珠单抗（Trastuzumab deruxtecan）在HER2突变的实体瘤中有效，在非小细胞肺癌中获益尤为显著；⑩ VEGFR1、2、3或PDGFRB突变的肺癌患者可能对TKI（如：安罗替尼Anlotinib）敏感；⑪ CDK4/6突变的肺癌患者可能对CDK4/6抑制剂（如：曲拉西利Trilaciclib）敏感；⑫ CDK4/6的肺癌患者可能对PD-L1抑制剂（如：阿替利珠单抗Atezolizumab、度伐利尤单抗Durvalumab）敏感。EGFR-TKI的耐药机制，大致分成两类 ① EGFR本身的突变：T790M和C797S突变；② 旁路途径的激活：如MET扩增、HER2扩增等； ◆ 评估免疫治疗：① 一般认为TMB高的肿瘤可能产生更多的肿瘤新生抗原（Neoantigens）。TMB高的患者（TMB≥10muts/Mb）比TMB低的患者对PD-1/PD-L1免疫抑制治疗更加敏感；② MSI-H表型的晚期实体肿瘤倾向于从免疫检查点抑制剂疗法（PD-1/PD-L1抑制剂）中获益；③ HLA-I（HLA-A、HLA-B、HLA-C）杂合性与免疫治疗后生存期的增加相关，三个基因全部杂合的位点对免疫治疗更敏感。HLA-I杂合与TMB高的患者比单独TMB高的患者也具有更高的生存率； ◆ 遗传风险评估：① 帮助有肿瘤家族史的高危人群提早进行肿瘤发生风险的评估，提供早期的预防干预方案，降低患病风险；② 对有家族遗传史或生育过患儿的并夫妇进行生育指导，有助于避免严重遗传病患儿的出生；③ 为临床实现精准的肿瘤个性化诊断及遗传咨询提供依据； ◆ 指导化疗用药：① 基于PharmGKB数据库，检测了2级及以上等级证据支持的化疗有关基因的SNP位点，预测化疗药物的毒性与有效性；② 在精准化疗之前，可进行化疗药物相关基因检测，从而制定个体化的化疗方案，以达到最大的化疗效果和最小的药物不良反应。

初诊、转移或复发肿瘤患者（尤其适合转移/复发/靶药耐药进展患者）。

10个工作日

石蜡切片/固定组织/外周血/口腔拭子

◆ 石蜡切片：10-15张，4-5μm厚，非粘附载玻片；或 ◆ 固定组织：穿刺组织不少于2条（长度≥5mm），或 手术组织 0.5×0.5×0.5~1cm（黄豆大小），10%中性福尔马林固定；和 ◆ 胚系对照：外周血，EDTA抗凝，≥2ml；或 口腔拭子 ≥2根

室温（15-25℃）保存，48小时内送检