实体肿瘤全景cfDNAseq(638基因)
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检测项目:
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检测方法:
DNA NGS
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检测内容:
638个靶基因:①SNV、InDel、常见融合;②靶基因CNV;③MSI、TMB、HLA分型、HRD和化疗药。
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临床意义:
◆ 辅助临床诊断:① 3p和9p染色体上关键基因TGFBR2和CDKN2A的缺失似乎是鼻咽癌的早期事件,可作为潜在的辅助临床诊断标志物;② EGFR和TP53突变在鼻咽癌晚期中具有较高的发生率,且和不良预后相关; ◆ 指导靶向用药:① EGFR突变的患者可能对EGFR抑制剂(如:西妥昔单抗Cetuximab、尼妥珠单抗Nimotuzumab)敏感; ② PIK3CA激活突变的患者可能对PIK3CA抑制剂(如:阿培利西Alpelisib)敏感;③ PD-L1阳性的患者可能对PD-1抑制剂(如:帕博利珠单抗Pembrolizumab、纳武利尤单抗Nivolumab)敏感;MSI-H表型的晚期实体肿瘤倾向于从免疫检查点抑制剂疗法(PD-1/PD-L1抑制剂)中获益; ◆ 评估免疫治疗:HLA-I(HLA-A、HLA-B、HLA-C)杂合性与免疫治疗后生存期的增加相关,三个基因全部杂合的位点对免疫治疗更敏感。HLA-I杂合与TMB高的患者比单独TMB高的患者也具有更高的生存率; ◆ 遗传风险评估:① 帮助有肿瘤家族史的高危人群提早进行肿瘤发生风险的评估,提供早期的预防干预方案,降低患病风险;② 对有家族遗传史或生育过患儿的并夫妇进行生育指导,有助于避免严重遗传病患儿的出生;③ 为临床实现精准的肿瘤个性化诊断及遗传咨询提供依据; ◆ 指导化疗用药:① 基于PharmGKB数据库,检测了2级及以上等级证据支持的化疗有关基因的SNP位点,预测化疗药物的毒性与有效性;② 在精准化疗之前,可进行化疗药物相关基因检测,从而制定个体化的化疗方案,以达到最大的化疗效果和最小的药物不良反应。
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适用人群:
初诊、转移或复发肿瘤患者。
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报告时间:
10个工作日
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样本类型:
外周血/胸腹水/脑脊液
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采集要求:
◆ 外周血(cfDNA):游离DNA保存管,≥20ml;或 ◆ 胸腹水(cfDNA):无菌离心管,≥50ml;或 ◆ 脑脊液(cfDNA):游离DNA保存管,≥10ml
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保存和运输:
◆ 外周血:室温(15-25℃)保存,48小时内送检 ◆ 脑脊液、胸腹水:2-8℃保存,当天送达