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实体肿瘤

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实体肿瘤 Solid Tumor
项目明细
检测项目:

实体肿瘤全景DNAseq PLUS(638基因)

检测方法:

DNA NGS

检测内容:

638个靶基因:①SNV、InDel、常见融合和CNV;②全基因组CNV&LOH;③MSI、TMB、HLA分型、HRD和化疗药;④AI肿瘤原发灶预测。

临床意义:

◆ 辅助临床诊断:① 粘液表皮样癌常见MAML2重排,其中有40%-90%病例出现CRTC1::MAML2融合;② MYB/MYBL1重排有助于腺样囊性癌的诊断,有14%的病例出现NOTCH突变;③ 腺泡细胞癌常见NR4A3融合(86%)少数MSANTD3融合(4%);④ 分泌性癌常见EVT6和RET的重排,大约90%的分泌性癌出现EVT6::NTRK3融合,一小部分病例出现ETV6::RET、ETV6::MET、ETV6::MAML3和VIM::RET;MEF2C::SS18融合有助于微分泌癌的诊断;⑤ 检测PRKD1 p.E710D热点突变或PRKD1、PRKD2或PRKD3重排对分泌性腺癌的诊断具有高度特异性;⑥ 大多数透明细胞癌病例中可检测到EWSR1融合基因;⑦ 部分基底细胞腺癌可见CYLD突变;⑧ 导管内癌可见RET重排(47%)以及PIK3CA和HRAS突变;⑨ 唾液腺导管癌最常见的基因改变是 TP53(55%)、HRAS(23%)和PIK3CA(23%)突变;⑩ ERBB2扩增(35%)、PTEN缺失;和BRAF致病性突变;⑪ 部分可见PLAG1(27%)和HMGA2(18%)重排;⑫ 肌上皮癌可见PLAG1重排(38%)和EWSR1::ATF1融合(13%);⑬ 上皮-肌上皮癌常见HRAS突变(78%);⑭ AKT1 p.E17K的突变有助于粘液性腺癌的诊断;⑮ 检测PLAG1或HMGA2重排有助于癌前多形性腺瘤的诊断,癌前多形性腺瘤常见TP53突变(60%); ◆ 指导靶向用药:① NTRK基因融合阳性的肿瘤患者可用NTRK抑制剂(如:拉罗替尼Larotrectinib、恩曲替尼Entrectinib); ② HER2扩增阳性患者可使用HER2抑制剂(如:曲妥珠单抗Trastuzumab);③ PIK3CA激活突变的患者可能对PIK3CA抑制剂(如:阿培利西Alpelisib)敏感;④ RET融合对其TKI(如:普拉替尼Pralsetinib等)敏感;⑤ BRAF V600E阳性提示可能有BRAF V600E相关分子改变可能对BRAF抑制剂(如:达拉非尼Dabrafenib)联合MEK抑制剂(如:曲美替尼Trametinib)敏感; ◆ 评估免疫治疗:① HLA-I(HLA-A、HLA-B、HLA-C)杂合性与免疫治疗后生存期的增加相关,三个基因全部杂合的位点对免疫治疗更敏感。HLA-I杂合与TMB高的患者比单独TMB高的患者也具有更高的生存率; ◆ 遗传风险评估:① 帮助有肿瘤家族史的高危人群提早进行肿瘤发生风险的评估,提供早期的预防干预方案,降低患病风险;② 对有家族遗传史或生育过患儿的并夫妇进行生育指导,有助于避免严重遗传病患儿的出生;③ 为临床实现精准的肿瘤个性化诊断及遗传咨询提供依据; ◆ 指导化疗用药:① 基于PharmGKB数据库,检测了2级及以上等级证据支持的化疗有关基因的SNP位点,预测化疗药物的毒性与有效性;② 在精准化疗之前,可进行化疗药物相关基因检测,从而制定个体化的化疗方案,以达到最大的化疗效果和最小的药物不良反应。

适用人群:

初诊、转移或复发肿瘤患者。

报告时间:

10个工作日

样本类型:

石蜡切片/固定组织/外周血/口腔拭子

采集要求:

◆ 石蜡切片:10-15张,4-5μm厚,非粘附载玻片;或 ◆ 固定组织:穿刺组织不少于2条(长度≥5mm),或 手术组织 0.5×0.5×0.5~1cm(黄豆大小),10%中性福尔马林固定;和 ◆ 胚系对照:外周血,EDTA抗凝,≥2ml;或 口腔拭子 ≥2根

保存和运输:

室温(15-25℃)保存,48小时内送检