实体肿瘤全景cfDNAseq(638基因)
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检测项目:
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检测方法:
DNA NGS
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检测内容:
638个靶基因:①SNV、InDel、常见融合;②靶基因CNV;③MSI、TMB、HLA分型、HRD和化疗药。
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临床意义:
◆ 辅助临床诊断:TP53、ERBB2、CDKN2A、ARID1A和KRAS等基因改变常见于胃食管交界处腺癌; ◆ 指导靶向用药:HER2过表达的转移性食管腺癌,推荐使用曲妥珠单抗(Trastuzumab)联合化疗治疗; ◆ 评估免疫治疗:① 一般认为TMB高的肿瘤可能产生更多的肿瘤新生抗原(Neoantigens)。TMB高的患者(TMB≥10muts/Mb)比TMB低的患者对PD-1/PD-L1免疫抑制治疗更加敏感;② MSI-H表型的晚期实体肿瘤倾向于从免疫检查点抑制剂疗法(PD-1/PD-L1抑制剂)中获益;③ HLA-I(HLA-A、HLA-B、HLA-C)杂合性与免疫治疗后生存期的增加相关,三个基因全部杂合的位点对免疫治疗更敏感。HLA-I杂合与TMB高的患者比单独TMB高的患者也具有更高的生存率; ◆ 遗传风险评估:① 帮助有肿瘤家族史的高危人群提早进行肿瘤发生风险的评估,提供早期的预防干预方案,降低患病风险;② 对有家族遗传史或生育过患儿的并夫妇进行生育指导,有助于避免严重遗传病患儿的出生;③ 为临床实现精准的肿瘤个性化诊断及遗传咨询提供依据。如:Li-Fraumeni综合征(胚系TP53致病突变所致)表现为明显的家族聚集性、肿瘤早发性以及肿瘤类型多样性(如软组织肉瘤、骨肉瘤、乳腺癌、白血病、脑瘤和肾上腺皮质肿瘤)。TP53突变的个体中,软组织肉瘤的发病率为12%-21%。携带胚系TP53致病突变的患者,应尽量避免使用放疗或具有基因毒性的化疗药物,以防促进新的原发肿瘤出现,并建议每年进行全身MRI监测; ◆ 指导化疗用药:① 基于PharmGKB数据库,检测了2级及以上等级证据支持的化疗有关基因的SNP位点,预测化疗药物的毒性与有效性;② 在精准化疗之前,可进行化疗药物相关基因检测,从而制定个体化的化疗方案,以达到最大的化疗效果和最小的药物不良反应。
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适用人群:
初诊或耐药肿瘤且组织样本不可及的患者。
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报告时间:
10个工作日
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样本类型:
外周血/胸腹水/脑脊液
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采集要求:
◆ 外周血(cfDNA):游离DNA保存管,≥20ml;或 ◆ 胸腹水(cfDNA):无菌离心管,≥50ml;或 ◆ 脑脊液(cfDNA):游离DNA保存管,≥10ml
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保存和运输:
◆ 外周血:室温(15-25℃)保存,48小时内送检 ◆ 脑脊液、胸腹水:2-8℃保存,当天送达