实体肿瘤DNAseq MAX
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检测项目:
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检测方法:
DNA NGS
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检测内容:
① 实体肿瘤全景DNAseq PLUS (638基因+全基因组CNV)+全外显子测序(体系,300x) ② 实体瘤微小残留病(MRD)检测*6次。
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临床意义:
◆ 辅助临床诊:TP53、ERBB2、CDKN2A、ARID1A和KRAS等基因改变常见于胃食管交界处腺癌,此外,根据分子改变不同可对胃癌进行分子病理分型:① TCGA分型:EBV感染型(EBV+)、微卫星不稳定型(MSI)、基因组稳定型(GS)和染色体不稳定型(CIN);② ACRG分型:微卫星不稳定型(MSI)、MSS/上皮间质转化型、MSS/p53活性型和MSS/p53无活性型; ◆ 指导靶向用药:① ERBB2(HER2)扩增患者往往对HER2抑制剂(如:曲妥珠单抗Trastuzumab等)治疗更敏感;② 微卫星不稳定型(MSI-H)患者可以从PD-1/PD-L1抑制剂(如:纳武利尤单抗Nivolumab、帕博利珠单抗Pembrolizumab等)治疗中获益;③ NTRK融合变异阳性的患者可能对NTRK抑制剂(如:拉罗替尼Larotrectinib、恩曲替尼Entrectinib)治疗敏感;④ 同源重组修复缺陷(HRD)阳性患者可能对PARP抑制剂(如:奥拉帕利Olaparib)治疗敏感; ◆ 评估免疫治疗:① 一般认为TMB高的肿瘤可能产生更多的肿瘤新生抗原(Neoantigens)。TMB高的患者(TMB≥10muts/Mb)比TMB低的患者对PD-1/PD-L1免疫抑制治疗更加敏感;② MSI-H表型的晚期实体肿瘤倾向于从PD-1(如:纳武利尤单抗和帕博利珠单抗)免疫治疗中获益;③ HLA-I(HLA-A、HLA-B、HLA-C)杂合性与免疫治疗后生存期的增加相关,三个基因全部杂合的位点对免疫治疗更敏感。HLA-I杂合与TMB高的患者比单独TMB高的患者也具有更高的生存率; ◆ 遗传风险评估:人群中3-5%的胃癌是由家族遗传基因突变所致,称之为遗传性胃癌,相关基因改变包括:CDH1基因突变(遗传性弥漫性胃癌)、DNA错配修复(MMR)基因突变(Lynch综合症伴胃癌风险)、APC基因突变(家族性腺瘤性息肉病和Gardner综合症伴胃癌风险)和STK11基因突变(Peutz-Jeghers综合征); ◆ 指导化疗用药:① 基于PharmGKB数据库,检测了2级及以上等级证据支持的化疗有关基因的SNP位点,预测化疗药物的毒性与有效性;② 在精准化疗之前,可进行化疗药物相关基因检测,从而制定个体化的化疗方案,以达到最大的化疗效果和最小的药物不良反应。③ UGT1A1*28等位基因的存在可导致伊立替康活性代谢产物SN-38的显著增加,从而发生腹泻/中性粒细胞减少的几率显著增加;④ 接受氟尿嘧啶类药物治疗的患者,需要考虑DPYD的基因状态,并根据突变状态给予合适的药物剂量; ◆ MRD监测:MRD监测在评估治疗效果和预测复发方面具有潜在价值,MRD阳性往往预示着较高的复发率和较低的生存率。此外,动态监测MRD水平有助于实时评估全身治疗的疗效,指导个体化治疗方案的调整。
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适用人群:
初诊、转移或复发肿瘤患者。
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报告时间:
◆ 初诊:10个工作日 ◆ 初次MRD:30天 ◆ 后续MRD:10个工作日
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样本类型:
石蜡切片/固定组织/外周血/口腔拭子
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采集要求:
◆ 石蜡切片:10-15张,4-5μm厚,非粘附载玻片;或 ◆ 固定组织:穿刺组织不少于2条(长度≥5mm),或 手术组织 0.5×0.5×0.5~1cm(黄豆大小),10%中性福尔马林固定;和 ◆ 胚系对照:外周血,EDTA抗凝,≥2ml;或 口腔拭子 ≥2根
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保存和运输:
室温(15-25℃)保存,48小时内送检