实体肿瘤全景DNAseq（638基因）

DNA NGS

638个靶基因：①SNV、InDel、常见融合；②靶基因CNV；③MSI、TMB、HLA分型、HRD和化疗药。

◆ 辅助临床诊断：① TERT启动子区变异在低级别和高级别肝脏增生性结节中经常出现，被认为是肝细胞癌（HCC）发生的早期分子事件，可作为潜在的辅助临床诊断标志物；② 晚期HCC患者肿瘤组织中可检测到TP53（35%）和WNT/β-catenin信号通路突变（45%），并且表现为相互独立的分子亚型；③ HCC患者中VEGFA扩增率为7％-11％。MET突变在HCC中的发生频率约为1.89%。在胆管细胞癌（CCA）中的突变频率约为1.44%，5％-14％的HCC中存在FGF19、CCND1（染色体11q13中的增加）异常，且其高表达水平和患者不良预后相关。IDH1/IDH2突变在肝内胆管癌（ICC）中的出现频率为10％-23%。HER2基因突变在CCA中发生频率约为3.9%，在胆囊癌中约为11%；④ PI3K/mTOR信号通路相关的基因有PIK3CA、PTEN、STK11、TSC1、TSC2、MTOR等，是肝胆肿瘤中最重要的信号通路之一；⑤ 11%的ICC和3%的胆囊癌可检测到FGFR1-3基因变异。在11％-45%的CCA中检测到FGFR2基因融合，常见形式主要有FGFR2::ZMYM4、FGFR2::BICC1融合等；⑥ 胆道肿瘤中BRAF突变频率的差异很大：胆囊癌的变异频率为0%-33%，CCA的变异频率为0%-22%； ◆ 指导靶向用药：① 有NTRK融合基因的患者可能对NTRK抑制剂（如：恩曲替尼Entrectinib、拉罗替尼Larotrectinib）敏感；② MSI-H/dMMR或者TMB-H的肿瘤患者可以帕博利珠单抗（2A类）；③ 后续治疗中对于有FGFR2融合或者重排的患者可能对FGFR2抑制剂（如：培米替尼Pemigatinib）敏感；④ 后续治疗中对于伴IDH1突变的胆管癌可能对IDH1抑制剂（如：艾伏尼布Ivosidenib）敏感；⑤ BRAF V600E突变患者可能对BRAF抑制剂（如：达拉非尼Dabrafenib）联合MEK抑制剂（如：曲美替尼Trametinib）敏感； ◆ 评估免疫治疗：① 一般认为TMB高的肿瘤可能产生更多的肿瘤新生抗原（Neoantigens）。TMB高的患者（TMB≥10muts/Mb）比TMB低的患者对PD-1/PD-L1免疫抑制治疗更加敏感；② MSI-H表型的晚期实体肿瘤倾向于从免疫检查点抑制剂疗法（PD-1/PD-L1抑制剂）中获益；③ HLA-I（HLA-A、HLA-B、HLA-C）杂合性与免疫治疗后生存期的增加相关，三个基因全部杂合的位点对免疫治疗更敏感。HLA-I杂合与TMB高的患者比单独TMB高的患者也具有更高的生存率； ◆ 遗传风险评估：帮助有肝胆管癌或其他相关肿瘤家族史的高危人群提早进行肿瘤发生风险的评估，提供早期的预防干预方案，降低患病风险；对有家族遗传史或生育过患儿的夫妇进行生育指导，有助于避免严重遗传病患儿的出生；为临床实现精准的肿瘤个性化诊断及遗传咨询提供依据； ◆ 指导化疗用药：① 基于PharmGKB数据库，检测了2级及以上等级证据支持的化疗有关基因的SNP位点，预测化疗药物的毒性与有效性；② 在精准化疗之前，可进行化疗药物相关基因检测，从而制定个体化的化疗方案，以达到最大的化疗效果和最小的药物不良反应。

初诊、转移或复发肿瘤患者（尤其适合转移/复发/靶药耐药进展患者）。

10个工作日

石蜡切片/固定组织/外周血/口腔拭子

◆ 石蜡切片：10-15张，4-5μm厚，非粘附载玻片；或 ◆ 固定组织：穿刺组织不少于2条（长度≥5mm），或 手术组织 0.5×0.5×0.5~1cm（黄豆大小），10%中性福尔马林固定；和 ◆ 胚系对照：外周血，EDTA抗凝，≥2ml；或 口腔拭子 ≥2根

室温（15-25℃）保存，48小时内送检