实体肿瘤全景DNAseq(638基因)
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检测项目:
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检测方法:
DNA NGS
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检测内容:
638个靶基因:①SNV、InDel、常见融合;②靶基因CNV;③MSI、TMB、HLA分型、HRD和化疗药。
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临床意义:
◆ 辅助临床诊断:① VHL、PBRM1、SETD2、BAP1、KDM5C、KDM6A、TSC1、TSC2、MTOR、PIK3CA、PTEN和TP53等基因以及3p、14和9号染色体缺失是透明细胞肾细胞癌的常见改变;② 乳头状肾细胞癌(PRCC)常见改变:7号和17号染色体的三体和四体以及Y染色体的缺失,MET基因突变在低级别PRCC中更常见; ◆ 指导靶向用药:① 作用于VEGF治疗肾癌的最常见靶向治疗药物有:舒尼替尼(Sunitinib)、帕唑帕尼(Pazopanib)、索拉非尼(Sorafenib)、卡博替尼(Cabozantinib);② 对mTOR起作用以治疗肾癌的最常见靶向治疗药物是坦罗莫司(Temsirolimus)、依维莫司(Everolimus);③ 作用于酪氨酸激酶(称为酪氨酸激酶抑制剂)以治疗晚期肾癌的靶向治疗药物是仑伐替尼(Lenvima); ④ mTOR抑制剂的耐药机制可能与以下因素有关:FKBP12或mTOR的变异;PI3K/AKT通路的激活;ERK/MAPK旁路信号的传导增强;PIM激酶的激活; ◆ 评估免疫治疗:① 一般认为TMB高的肿瘤可能产生更多的肿瘤新生抗原(Neoantigens)。TMB高的患者(TMB≥10muts/Mb)比TMB低的患者对PD-1/PD-L1免疫抑制治疗更加敏感;② MSI-H表型的晚期实体肿瘤倾向于从免疫检查点抑制剂疗法(PD-1/PD-L1抑制剂)中获益;③ HLA-I(HLA-A、HLA-B、HLA-C)杂合性与免疫治疗后生存期的增加相关,三个基因全部杂合的位点对免疫治疗更敏感。HLA-I杂合与TMB高的患者比单独TMB高的患者也具有更高的生存率; ◆ 遗传风险评估:① 帮助有肿瘤家族史的高危人群提早进行肿瘤发生风险的评估,提供早期的预防干预方案,降低患病风险;② 对有家族遗传史或生育过患儿的并夫妇进行生育指导,有助于避免严重遗传病患儿的出生;③ 为临床实现精准的肿瘤个性化诊断及遗传咨询提供依据; ◆ 指导化疗用药:① 基于PharmGKB数据库,检测了2级及以上等级证据支持的化疗有关基因的SNP位点,预测化疗药物的毒性与有效性;② 在精准化疗之前,可进行化疗药物相关基因检测,从而制定个体化的化疗方案,以达到最大的化疗效果和最小的药物不良反应。
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适用人群:
初诊、转移或复发肿瘤患者(尤其适合转移/复发/靶药耐药进展患者)。
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报告时间:
10个工作日
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样本类型:
石蜡切片/固定组织/外周血/口腔拭子
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采集要求:
◆ 石蜡切片:10-15张,4-5μm厚,非粘附载玻片;或 ◆ 固定组织:穿刺组织不少于2条(长度≥5mm),或 手术组织 0.5×0.5×0.5~1cm(黄豆大小),10%中性福尔马林固定;和 ◆ 胚系对照:外周血,EDTA抗凝,≥2ml;或 口腔拭子 ≥2根
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保存和运输:
室温(15-25℃)保存,48小时内送检