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实体肿瘤

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实体肿瘤 Solid Tumor
项目明细
检测项目:

实体肿瘤全景DNAseq PLUS(638基因)

检测方法:

DNA NGS

检测内容:

638个靶基因:①SNV、InDel、常见融合和CNV;②全基因组CNV&LOH;③MSI、TMB、HLA分型、HRD和化疗药;④AI肿瘤原发灶预测。

临床意义:

◆ 辅助临床诊断:① 乳腺癌常见分子改变包含HER2突变和扩增、BRCA1/2体系或胚系突变、TP53和PIK3CA突变、NTRK、RET融合等;BRCA基因胚系突变患者增加乳腺癌和卵巢癌复发风险; ◆ 指导靶向用药:① BRCA基因突变患者往往对铂类、蒽环类更敏感;② BRCA1/2突变的患者可以从PARP抑制剂(如:奥拉帕利和他拉唑帕利)中获益;③ 无BRCA1/2突变,但HRD阳性患者也可能对PARP抑制剂(如:奥拉帕利Olaparib、帕米帕利Pamiparib和尼拉帕利Niraparib等)敏感;④ 有HRR信号通路基因突变的患者可能对PARP抑制剂(如:奥拉帕利Olaparib等)敏感;⑤ PIK3CA激活突变的患者可能对PIK3CA抑制剂(如:阿培利西Alpelisib)敏感;⑥ HER2扩增阳性患者可使用靶向药物曲妥珠单抗进行治疗;⑦ 部分基因改变可能导致患者耐药:内分泌耐药,大约70%的乳腺癌呈ER阳性,在转移性雌激素受体(ER)阳性乳腺癌的芳香化酶抑制剂(AI)治疗期间获得配体非依赖性ESR1突变是激素治疗耐药的常见机制。ESR1患者突变阳性转移瘤对内分泌(ET)具有抗性,并表现出较差的总体生存率;RB1突变可能对CDK4/6抑制剂耐药; ◆ 评估免疫治疗:① 一般认为TMB高的肿瘤可能产生更多的肿瘤新生抗原(Neoantigens)。TMB高的患者(TMB≥10muts/Mb)比TMB低的患者对PD-1/PD-L1免疫抑制治疗更加敏感;② MSI-H表型的晚期实体肿瘤倾向于从免疫检查点抑制剂疗法(PD-1/PD-L1抑制剂)中获益;③ HLA-I(HLA-A、HLA-B、HLA-C)杂合性与免疫治疗后生存期的增加相关,三个基因全部杂合的位点对免疫治疗更敏感。HLA-I杂合与TMB高的患者比单独TMB高的患者也具有更高的生存率; ◆ 遗传风险评估:① 帮助有肿瘤家族史的高危人群提早进行肿瘤发生风险的评估,提供早期的预防干预方案,降低患病风险;② 对有家族遗传史或生育过患儿的夫妇进行生育指导,有助于避免严重遗传病患儿的出生;③ 为临床实现精准的肿瘤个性化诊断及遗传咨询提供依据;④ 研究表明,5%-10%的的乳腺癌患者具有明确的遗传基因突变,称之为遗传性乳腺癌,而BRCA1/2基因突变占15%;⑤ 携带BRCA1/2基因突变的人患乳腺癌和卵巢癌等遗传性肿瘤风险大大增加,发生遗传性乳腺癌的风险为56%-87%,发生遗传性卵巢癌的风险为27%-48%; ◆ 指导化疗用药:① 基于PharmGKB数据库,检测了2级及以上等级证据支持的化疗有关基因的SNP位点,预测化疗药物的毒性与有效性;② 在精准化疗之前,可进行化疗药物相关基因检测,从而制定个体化的化疗方案,以达到最大的化疗效果和最小的药物不良反应。

适用人群:

初诊、转移或复发肿瘤患者(尤其适合转移/复发/靶药耐药进展患者)。

报告时间:

10个工作日

样本类型:

石蜡切片/固定组织/外周血/口腔拭子

采集要求:

◆ 石蜡切片:10-15张,4-5μm厚,非粘附载玻片;或 ◆ 固定组织:穿刺组织不少于2条(长度≥5mm),或 手术组织 0.5×0.5×0.5~1cm(黄豆大小),10%中性福尔马林固定;和 ◆ 胚系对照:外周血,EDTA抗凝,≥2ml;或 口腔拭子 ≥2根

保存和运输:

室温(15-25℃)保存,48小时内送检