实体肿瘤全景DNAseq PLUS(638基因)
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检测项目:
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检测方法:
DNA NGS
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检测内容:
638个靶基因:①SNV、InDel、常见融合和CNV;②全基因组CNV&LOH;③MSI、TMB、HLA分型、HRD和化疗药;④AI肿瘤原发灶预测。
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临床意义:
◆ 辅助临床诊断:① 宫颈癌常见分子改变:HER2扩增、RET和NTRK重排、PIK3CA;② HPV无关型鳞状细胞癌常见分子改变:TP53, KRAS, ARID1A and PTEN; ◆ 指导靶向用药:① PTEN突变的患者可以从mTOR抑制剂(如:依维莫司Everolimus)中获益;② PIK3CA激活突变的患者可能对PIK3CA抑制剂(如:阿培利西Alpelisib)敏感;③ HER2扩增,那么诸如曲妥珠单抗等药物则可能延长生存期;④ FDA批准NTRK重排的患者对NTRK抑制剂(如:拉罗替尼Larotrectinib、恩曲替尼Entrectinib)敏感;⑤ HRD阳性患者也可能对PARP抑制剂(如:奥拉帕利Olaparib、帕米帕利Pamiparib和尼拉帕利Niraparib等)敏感; ◆ 评估免疫治疗:① 一般认为TMB高的肿瘤可能产生更多的肿瘤新生抗原(Neoantigens)。FDA批准TMB高的患者(TMB≥10muts/Mb)对帕博利珠单抗(Pembrolizumab)敏感;② FDA批准MSI-H/dMMR表型患者倾向于从帕博利珠单抗(Pembrolizumab)免疫治疗中获益;③ HLA-I(HLA-A、HLA-B、HLA-C)杂合性与免疫治疗后生存期的增加相关,三个基因全部杂合的位点对免疫治疗更敏感。HLA-I杂合与TMB高的患者比单独TMB高的患者也具有更高的生存率; ◆ 遗传风险评估:① 帮助有肿瘤家族史的高危人群提早进行肿瘤发生风险的评估,提供早期的预防干预方案,降低患病风险;② 对有家族遗传史或生育过患儿的并夫妇进行生育指导,有助于避免严重遗传病患儿的出生;③ 为临床实现精准的肿瘤个性化诊断及遗传咨询提供依据;④ STK11基因的种系突变与Peutz-Jeghers综合征有关,是子宫宫颈腺癌,HPV非依赖性胃型的常见病因,患者的宫颈癌风险增加; ◆ 指导化疗用药:① 基于PharmGKB数据库,检测了2级及以上等级证据支持的化疗有关基因的SNP位点,预测化疗药物的毒性与有效性;② 在精准化疗之前,可进行化疗药物相关基因检测,从而制定个体化的化疗方案,以做到最大的化疗效果和最小的药物不良反应;③ ERCC1、MTHFR等基因可评估化疗药物的敏感性和毒性。
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适用人群:
初诊、转移或复发肿瘤患者(尤其适合转移/复发/靶药耐药进展患者)。
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报告时间:
10个工作日
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样本类型:
石蜡切片/固定组织/外周血/口腔拭子
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采集要求:
◆ 石蜡切片:10-15张,4-5μm厚,非粘附载玻片;或 ◆ 固定组织:穿刺组织不少于2条(长度≥5mm),或 手术组织 0.5×0.5×0.5~1cm(黄豆大小),10%中性福尔马林固定;和 ◆ 胚系对照:外周血,EDTA抗凝,≥2ml;或 口腔拭子 ≥2根
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保存和运输:
室温(15-25℃)保存,48小时内送检