实体肿瘤DNAseq MAX

DNA NGS

① 实体肿瘤全景DNAseq PLUS （638基因+全基因组CNV）+全外显子测序（体系，300x） ② 实体瘤微小残留病（MRD）检测*6次。

◆ 辅助临床诊断：1.确定分子分型：肿瘤基因图谱（TCGA）提出了子宫内膜癌的分子分型计划，应用多平台分析，整合基因组学、转录组学、蛋白组学、基因拷贝数量和甲基化数据，研究并划分了4类不同的分子亚型。① POLE超突变（POLE acculturated）；② 微卫星不稳定高突变（Micro satellite instability hyper mutated, MSI-H）；③ 低拷贝数异常（Copy number abnormalities-low, CN-L），TP53野生；④ 高拷贝数异常（Copy number abnormalities-high, CN-H），TP53突变；基于以上分子分型，结合病理分类，指南将子宫内膜癌分为“子宫内膜样癌POLE”、“子宫内膜样癌MSI-H”、“子宫内膜样癌CN-L”和“浆液性癌、子宫内膜样癌CN-H”四类。2.判定预后分层：① 子宫内膜癌患者中POLE突变发生率约为7%，带有POLE突变患者的预后最好，CN-H发生率约为26 %，预后最差，MSI-H和CN-L总发生率约占67%，预后处于四型别的中间位置；② KRAS突变（密码子12或13）的存在与预后不良相关联，更具侵袭性； ◆ 指导靶向用药：① NCCN指南推荐HER2阳性患者对曲妥珠单抗敏感；② PIK3CA激活突变的患者可能对PIK3CA抑制剂（如：阿培利西Alpelisib）敏感；③ 在30％-60%的子宫内膜癌患者中存在PTEN缺失，患者可以从mTOR抑制剂（如：依维莫司Everolimus）中获益；④ FDA批准NTRK重排的患者对NTRK抑制剂（如：拉罗替尼Larotrectinib、恩曲替尼Entrectinib）敏感；⑤ KRAS突变可导致对 EGFR 抑制剂的耐药性； ◆ 评估免疫治疗：① 一般认为TMB高的肿瘤可能产生更多的肿瘤新生抗原（Neoantigens）。FDA批准TMB高的患者（TMB≥10muts/Mb）对帕博利珠单抗（Pembrolizumab）敏感；② NCCN指南推荐MSI-H/dMMR表型的子宫内膜癌肿瘤倾向于从帕博利珠单抗（Pembrolizumab）、纳武利尤单抗（Nivolumab）、多塔利单抗（Dostarlimab-gxly）和阿维鲁单抗（Avelumab）免疫治疗中获益；③ HLA-I（HLA-A、HLA-B、HLA-C）杂合性与免疫治疗后生存期的增加相关，三个基因全部杂合的位点对免疫治疗更敏感。HLA-I杂合与TMB高的患者比单独TMB高的患者也具有更高的生存率；⑤ POLE突变型和MSI-H型的TMB较高，这2类更易从免疫治疗中获益； ◆ 遗传风险评估：① 帮助有肿瘤家族史的高危人群提早进行肿瘤发生风险的评估，提供早期的预防干预方案，降低患病风险；② 对有家族遗传史或生育过患儿的并夫妇进行生育指导，有助于避免严重遗传病患儿的出生；③ 为临床实现精准的肿瘤个性化诊断及遗传咨询提供依据；④ 研究表明，MMR基因是子宫内膜癌的主要高外显率易感基因。对于有MLH1和MSH2胚系突变的女性，终生子宫内膜癌风险估计为40-60%；⑤ PTEN基因胚系突变与Cowden综合征有关； ◆ 指导化疗用药：① 基于PharmGKB数据库，检测了2级及以上等级证据支持的化疗有关基因的SNP位点，预测化疗药物的毒性与有效性；② 在精准化疗之前，可进行化疗药物相关基因检测，从而制定个体化的化疗方案，以做到最大的化疗效果和最小的药物不良反应；③ UMPS、DPYD、ERCC1、MTHFR等基因可评估化疗药物的敏感性和毒性； ◆ 基于tumor-informed MRD技术，首次对手术标本进行全外显子测序，制定16-49个肿瘤特异性基因检测Panel，后五次采用个体化Panel，进行MRD追踪； ◆ MRD监测在评估治疗效果和预测复发方面具有潜在价值，MRD阳性往往预示着较高的复发率和较低的生存率。此外，动态监测MRD水平有助于实时评估全身治疗的疗效，指导个体化治疗方案的调整。

初诊、转移或复发肿瘤患者。

◆ 初诊：10个工作日 ◆ 初次MRD：30天 ◆ 后续MRD：10个工作日

石蜡切片/固定组织/外周血/口腔拭子

◆ 石蜡切片：10-15张，4-5μm厚，非粘附载玻片；或 ◆ 固定组织：穿刺组织不少于2条（长度≥5mm），或 手术组织 0.5×0.5×0.5~1cm（黄豆大小），10%中性福尔马林固定；和 ◆ 胚系对照：外周血，EDTA抗凝，≥2ml；或 口腔拭子 ≥2根

室温（15-25℃）保存，48小时内送检